Ένα κρούσμα COVID-19 471 ημερών αποκαλύπτει πώς μεταλλάσσεται ο κοροναϊός
August 30, 2022Οπως και όμικρον υποπαραλλαγή ΒΑ.5 συνεχίζει να οδηγεί την εξάπλωση του κορωνοϊού στις Ηνωμένες Πολιτείες, σκέφτομαι τι θα μπορούσε να ακολουθήσει. Η Omicron και οι παραφυάδες της βρίσκονται στην κορυφή των τσαρτ παραλλαγής από τον περασμένο χειμώνα. Πριν από αυτό βασίλευε το δέλτα.
Οι επιστήμονες έχουν μερικές ιδέες για το πώς εμφανίζονται νέες παραλλαγές. Το ένα αφορά άτομα με επίμονες λοιμώξεις – άτομα που έχουν θετικά αποτελέσματα για τον ιό για παρατεταμένη χρονική περίοδο. Θα σας πω για την περίεργη περίπτωση ενός ατόμου που μολύνθηκε με SARS-CoV-2 για τουλάχιστον 471 ημέρες και τι μπορεί να συμβεί όταν οι λοιμώξεις εξαφανιστούν ανεξέλεγκτα.
Αυτή η μακροχρόνια μόλυνση εμφανίστηκε για πρώτη φορά στο ραντάρ του επιδημιολόγου Nathan Grubaugh το καλοκαίρι του 2021. Η ομάδα του ανέλυε στελέχη κορονοϊού σε δείγματα ασθενών από το νοσοκομείο Yale New Haven όταν ο Grubaugh εντόπισε κάτι που είχε δει στο παρελθόν. Γνωστή μόνο ως B.1.517, αυτή η έκδοση του ιού δεν απέκτησε ποτέ όνομα όπως το delta ή omicron, ούτε έσκασε σε κοινότητες όπως οι διαβόητοι συγγενείς του.
Αντίθετα, αφού εμφανίστηκε κάπου στη Βόρεια Αμερική στις αρχές του 2020, το B.1.517 χρησιμοποιήθηκε σε λίγες περιοχές σε όλο τον κόσμο, πυροδοτώντας ακόμη και ένα ξέσπασμα στην Αυστραλία. Αλλά μετά τον Απρίλιο του 2021, το B.1.517 φαινόταν να ψεκάζει, ένα από τα ποιος ξέρει πόσες ιογενείς γενεαλογίες που φουντώνουν και στη συνέχεια σβήνουν.
Το B.1.517 θα μπορούσε να είχε ξεχαστεί εδώ και πολύ καιρό, το οποίο είχε παραμεριστεί από την τελευταία παραλλαγή για να διακυβευτεί μια αξίωση στις τοπικές κοινωνίες. «Και όμως το βλέπαμε ακόμα», λέει ο Grubaugh. Ακόμη και μετά την εξάπλωση του B.1.517 σε ολόκληρη τη χώρα, η ομάδα του παρατήρησε ότι εμφανίστηκε σε δείγματα ασθενών. Η ίδια καταγωγή, κάθε λίγες βδομάδες, σαν ρολόι, για μήνες.
Μια ένδειξη ήταν η ταυτότητα του δείγματος των δειγμάτων. Ο κωδικός στα δείγματα B.1.517 ήταν πάντα ο ίδιος, παρατήρησε η ομάδα του Grubaugh. Είχαν προέλθει όλοι από έναν μόνο ασθενή.
Αυτός ο ασθενής, ένα άτομο στα 60 του με ιστορικό καρκίνου, υποτροπίασε τον Νοέμβριο του 2020. Αυτό ήταν ακριβώς όταν βγήκε θετικός στον SARS-CoV-2. Αφού είδε το B.1.517 να εμφανίζεται ξανά και ξανά στα δείγματά του, ο Grubaugh συνεργάστηκε με έναν κλινικό για να πάρει την άδεια του ασθενούς να αναλύσει τα δεδομένα του.
Τελικά, ο ασθενής έχει παρέμεινε μολυσμένο για 471 ημέρες (και μετρώντας), ο Grubaugh, ο μεταδιδακτορικός ερευνητής του Yale Chrispin Chaguza και η ομάδα τους ανέφεραν τον περασμένο μήνα σε μια προκαταρκτική μελέτη που δημοσιεύτηκε στο medRxiv.org. Λόγω της επιδείνωσης της υγείας και της επιθυμίας να διατηρήσουν την ανωνυμία τους, ο ασθενής δεν ήταν πρόθυμος να πάρει συνέντευξη και ο Grubaugh δεν έχει άμεση επαφή μαζί του.
Αλλά όλα αυτά τα δείγματα που συλλέχθηκαν όλες εκείνες τις μέρες είπαν μια απίστευτη ιστορία της εξέλιξης του ιού. Σε διάστημα περίπου 15 μηνών, τουλάχιστον τρεις γενετικά διακριτές εκδοχές του ιού είχαν εξελιχθεί γρήγορα μέσα στον ασθενή, πρότειναν οι αναλύσεις της ομάδας.
Κάθε εκδοχή είχε δεκάδες μεταλλάξεις και φαινόταν να συνυπάρχουν στο σώμα του ασθενούς. «Ειλικρινά, εάν κάποιο από αυτά εμφανιζόταν σε έναν πληθυσμό και άρχιζε να μεταδίδεται, θα το αποκαλούσαμε μια νέα παραλλαγή», λέει ο Grubaugh.
Αυτό το σενάριο είναι μάλλον σπάνιο, λέει. Άλλωστε, πολλές παρατεταμένες λοιμώξεις πιθανότατα έχουν εμφανιστεί κατά τη διάρκεια της πανδημίας και έχουν προκύψει μόνο λίγες από τις ανησυχητικές παραλλαγές. Αλλά η εργασία υποδηλώνει ότι οι επίμονες ιογενείς λοιμώξεις μπορούν να προσφέρουν μια παιδική χαρά για γρήγορους εξελικτικούς πειραματισμούς – ίσως εκμεταλλευόμενοι το εξασθενημένο ανοσοποιητικό σύστημα.
Το έργο του Grubaugh είναι «πιθανώς η πιο λεπτομερής ματιά που είχαμε σε μια μεμονωμένη, επίμονη μόλυνση με SARS-CoV-2 μέχρι στιγμής», λέει ο Tom Friedrich, ιολόγος στο Πανεπιστήμιο του Wisconsin–Madison, ο οποίος δεν ασχολήθηκε με την εργασία. .
Η μελέτη υποστηρίζει ένα παλαιότερο εύρημα σχετικά με έναν διαφορετικό ανοσοκατεσταλμένο ασθενή — έναν ασθενή με επίμονο λοίμωξη από όμικρον. Σε αυτή την εργασία, οι ερευνητές τεκμηρίωσαν την εξέλιξη του ιού σε διάστημα 12 εβδομάδων και έδειξαν ότι ο απόγονός του μόλυνε τουλάχιστον άλλα πέντε άτομα.
Μαζί, οι μελέτες περιγράφουν πώς τέτοιες λοιμώξεις θα μπορούσαν ενδεχομένως να οδηγήσουν στην εμφάνιση του επόμενου όμικρον.
«Είμαι πολύ καλά πεπεισμένος ότι τα άτομα με επίμονη μόλυνση είναι σημαντικές πηγές νέων παραλλαγών», λέει ο Friedrich.
Το ποιος ακριβώς αναπτύσσει αυτές τις λοιμώξεις παραμένει μυστήριο. Ναι, ο ιός μπορεί να χτυπήσει άτομα με εξασθενημένο ανοσοποιητικό σύστημα, αλλά «δεν αναπτύσσει κάθε ανοσοκατεσταλμένο άτομο μια επίμονη λοίμωξη», λέει η Viviana Simon, ιολόγος στο Icahn School of Medicine στο Mount Sinai που εργάστηκε στη μελέτη λοίμωξης omicron.
Στην πραγματικότητα, οι γιατροί και οι επιστήμονες δεν έχουν ιδέα πόσο συχνές είναι αυτές οι λοιμώξεις. «Απλώς δεν έχουμε πραγματικά τους αριθμούς», λέει ο Simon. Αυτό είναι ένα τεράστιο κενό για τους ερευνητές, και κάτι για το Όρος Σινά Πρόγραμμα επιτήρησης παθογόνων προσπαθεί να αντιμετωπίσει αναλύοντας δεδομένα μόλυνσης σε πραγματικό χρόνο.
Η μελέτη ασθενών με παρατεταμένες λοιμώξεις θα μπορούσε επίσης να πει στους επιστήμονες πού οδεύει η εξέλιξη του SARS-CoV-2, λέει ο Friedrich. Ακριβώς επειδή ο ιός εξελίσσεται μέσα σε ένα άτομο δεν σημαίνει ότι θα εξαπλωθεί και σε άλλους ανθρώπους. Αλλά αν ορισμένες ιικές μεταλλάξεις τείνουν να προκύψουν σε πολλά άτομα με επίμονες λοιμώξεις, αυτό θα μπορούσε να υποδηλώνει ότι η επόμενη μεγάλη παραλλαγή μπορεί να εξελιχθεί με παρόμοιο τρόπο. Η γνώση περισσότερων για αυτά τα μοτίβα μετάλλαξης θα μπορούσε να βοηθήσει τους ερευνητές να προβλέψουν τι θα ακολουθήσει, ένα σημαντικό βήμα στον σχεδιασμό μελλοντικών ενισχυτών εμβολίων κατά του κορωνοϊού.
Πέρα από τις προβλέψεις για ιούς, ο Grubaugh λέει ότι είναι σημαντικό να εντοπιστούν άτομα με παρατεταμένες λοιμώξεις, ώστε οι γιατροί να μπορούν να παρέχουν φροντίδα. «Πρέπει να τους δώσουμε πρόσβαση σε εμβόλια, μονοκλωνικά αντισώματα και αντιιικά φάρμακα», λέει. Αυτές οι θεραπείες θα μπορούσαν να βοηθήσουν τους ασθενείς να καθαρίσουν τις λοιμώξεις τους.
Αλλά ο εντοπισμός επίμονων λοιμώξεων είναι πιο εύκολο να ειπωθεί παρά να γίνει, επισημαίνει. Πολλά μέρη στον κόσμο δεν έχουν ρυθμιστεί για να εντοπίζουν αυτές τις λοιμώξεις και δεν έχουν πρόσβαση σε εμβόλια ή θεραπείες. Και ακόμη και όταν αυτά είναι διαθέσιμα, ορισμένοι ασθενείς εξαιρούνται. Ο ασθενής στη μελέτη του Grubaugh έλαβε έγχυση μονοκλωνικού αντισώματος περίπου 100 ημέρες μετά τη μόλυνση του και στη συνέχεια αρνήθηκε όλες τις άλλες θεραπείες. Δεν έχουν εμβολιαστεί.
Αν και ο ασθενής παρέμεινε μολυσματικός κατά τη διάρκεια της μελέτης, οι παραλλαγές τους δεν εξαπλώθηκαν ποτέ στην κοινότητα, από όσο γνωρίζει ο Grubaugh.
Και ενώ οι χρόνιες λοιμώξεις που δεν έχουν θεραπευθεί μπορεί να γεννήσουν νέες παραλλαγές, θα μπορούσαν να εμφανιστούν και με άλλους τρόπους, όπως από ζώα που έχουν μολυνθεί με τον ιό, από άτομο σε άτομο μετάδοση σε ομάδες ανθρώπων που οι επιστήμονες δεν παρακολουθούσαν ή από «κάτι άλλο που ίσως κανείς μας δεν το έχει σκεφτεί ακόμα», λέει. «Ο SARS-CoV-2 συνέχισε να μας εκπλήσσει με την εξέλιξή του».
